Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Satb1Q60611 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Satb1Q60611 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms