Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp20Q5XG71 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp20Q5XG71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms