Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13Q5SWW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Med13Q5SWW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med13Q5SWW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms