Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
NacadQ5SWP3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NacadQ5SWP3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NacadQ5SWP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
NacadQ5SWP3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms