Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ssh2Q5SW75 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ssh2Q5SW75 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ssh2Q5SW75 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ssh2Q5SW75 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms