Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PfasQ5SUR0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PfasQ5SUR0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms