Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Utp18Q5SSI6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Utp18Q5SSI6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Utp18Q5SSI6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp18Q5SSI6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms