Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zzef1Q5SSH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zzef1Q5SSH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zzef1Q5SSH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms