Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sun3Q5SS91 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sun3Q5SS91 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms