Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps54Q5SPW0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps54Q5SPW0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps54Q5SPW0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms