Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.3 ms