Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna2d4Q5RJF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms