Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CoblQ5NBX1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CoblQ5NBX1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CoblQ5NBX1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CoblQ5NBX1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms