Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kctd1Q5M956 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kctd1Q5M956 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kctd1Q5M956 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kctd1Q5M956 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms