Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grhl3Q5FWH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grhl3Q5FWH3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grhl3Q5FWH3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grhl3Q5FWH3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms