Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8bQ5DU41 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms