Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1cQ4KL78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc1cQ4KL78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1cQ4KL78 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms