Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Brinp3Q499E0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Brinp3Q499E0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Brinp3Q499E0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brinp3Q499E0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brinp3Q499E0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms