Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt35Q497I4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms