Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx25Q3ZT31 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx25Q3ZT31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx25Q3ZT31 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx25Q3ZT31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms