Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700057G04RikQ3V0U0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700057G04RikQ3V0U0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms