Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms