Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc55Q3UY51 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc55Q3UY51 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms