Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B230104I21RikQ3USW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B230104I21RikQ3USW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B230104I21RikQ3USW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms