Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28047Q3US59 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28047Q3US59 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms