Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vwa5b2Q3UR50 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vwa5b2Q3UR50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms