Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm20Q3UQS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm20Q3UQS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm20Q3UQS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm20Q3UQS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms