Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skap2Q3UND0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap2Q3UND0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms