Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrxosQ3UL53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CrxosQ3UL53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrxosQ3UL53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms