Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJP5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJP5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UJP5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UJP5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UJP5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UJP5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UJP5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UJP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UJP5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UJP5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UJP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UJP5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UJP5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UJP5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UJP5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms