Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm648Q3UJ22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm648Q3UJ22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm648Q3UJ22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms