Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf224Q3UIW8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf224Q3UIW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf224Q3UIW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms