Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zswim8Q3UHH1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms