Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx27Q3UHD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx27Q3UHD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx27Q3UHD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx27Q3UHD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms