Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc10a4Q3UEZ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc10a4Q3UEZ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms