Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm45902Q3UDN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms