Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll12Q3UDE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttll12Q3UDE2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll12Q3UDE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms