Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LbrQ3U9G9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LbrQ3U9G9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms