Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf180Q3U827 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rnf180Q3U827 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf180Q3U827 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms