Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U595 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U595 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U595 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U595 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U595 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U595 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U595 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3U595 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3U595 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U595 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U595 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U595 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U595 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U595 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U595 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U595 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U595 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U595 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms