Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenplQ3U3S3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CenplQ3U3S3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms