Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gse1Q3U3C9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gse1Q3U3C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gse1Q3U3C9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gse1Q3U3C9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms