Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl4Q3TZA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl4Q3TZA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl4Q3TZA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms