Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psmd1Q3TXS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd1Q3TXS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd1Q3TXS7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmd1Q3TXS7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd1Q3TXS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms