Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q3TTL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q3TTL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TTL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms