Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uri1Q3TLD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uri1Q3TLD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uri1Q3TLD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uri1Q3TLD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Uri1Q3TLD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uri1Q3TLD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uri1Q3TLD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms