Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afvQ3THW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afvQ3THW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms