Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc127Q3TC33 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc127Q3TC33 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms