Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl9Q32KG4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rtl9Q32KG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms