Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdgfl1Q2VPR5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms